und da sind sie wieder.

Wie ich herausgefunden habe handelt es sich scheinbar um einen Bug im Zusammenhand mit Spaces. Obwohl Ich Spaces deaktiviert habe (weil ich meinen ext. Monitor angeschlossen habe und mich das dann nervt :D ) wurden die Fenster auf einmal den anderen (nicht wirklich vorhanden Desktops zugewiesen..). Ein Aktivieren von Spaces zeigte sie mir dann in der Übersicht an.

Das Deaktivieren brachte sie dann alle wieder auf meinen Desktop.